СИНОД. 1. Постоянный высший (коллегиальный!!!) орган управления некоторых церквей. 2. съезд высших архиереев некоторых церквей. Это слово возводят, напротив, к "древнегреческому" Σύνοδος "собрание", "собор".
Скорее всего оба термина произошли от нашей славянской ЗАДницы. В СЕНАТах и СИНОДах СИДят преЗИДенты, предСЕДатели и простые заСЕДатели. СУДачат - расСУжДают.
Звук Н, скорее всего, древний Н краткий (из буквы ЮС).
Ну, и, в заключении экскурса в древнерусский язык разрешите представить фото из википедии. Оцените лингвофрический юмор строителей Санкт Петербурга - здание СЕНАТА и СИНОДА на Галерной улице. 
Journal information